Cinq 茅quipes de 海角社区 re莽oivent des fonds dans le cadre du nouveau Programme d鈥檌nt茅gration de la g茅nomique
G茅nome Qu茅bec a annonc茅 aujourd鈥檋ui les r茅sultats de l鈥檃ppel de propositions du Programme d鈥檌nt茅gration de la g茅nomique, volet sant茅 humaine. Cinq 茅quipes de 海角社区 issues de domaines diversifi茅s ont re莽u des fonds totalisant pr猫s d鈥檜n million de dollars. Le programme se distingue en exigeant que les candidats affili茅s 脿 un institut de recherche aient 茅galement un partenaire externe non universitaire, soutenant ainsi les objectifs du programme de stimuler l鈥櫭ヽonomie qu茅b茅coise et d鈥檈ncourager l鈥檜tilisation des technologies g茅nomiques dans le syst猫me de sant茅 qu茅b茅cois.
芦 Le Qu茅bec conna卯t un fort engouement pour la g茅nomique depuis 20 ans, et l鈥檈xpertise et le leadership des chercheurs de 海角社区 ont jou茅 un r么le crucial dans la croissance de la discipline, fait remarquer Martha Crago, vice-principale 脿 la recherche et 脿 l鈥檌nnovation de l鈥橴niversit茅 海角社区. Ces derniers r茅sultats t茅moignent de la force de notre contribution au domaine, et viennent confirmer la diversit茅 et l鈥檈xpertise de notre communaut茅 intellectuelle. 禄
Les cinq projets qui suivent ont 茅t茅 s茅lectionn茅s par G茅nome Qu茅bec.
1. Nouveau logiciel pour cribler les antibiotiques agissant sur l鈥橝RN
Chercheuse principale (CP) : Maureen McKeague, titulaire de la Chaire de recherche du Canada en chimie du g茅nome, niveau 2, professeure adjointe, D茅partement de pharmacologie et de th茅rapeutique, Facult茅 de m茅decine et de sciences de la sant茅, D茅partement de chimie, Facult茅 des sciences
(Codemandeur/Co-CP) : Tony Mittermaier, professeur agr茅g茅, D茅partement de chimie)
Partenaire : Molecular Forecaster Inc.
R茅sum茅 : La r茅sistance bact茅rienne aux antibiotiques est actuellement l鈥檜ne des dix principales menaces de sant茅 publique mondiales. Il existe heureusement, une strat茅gie encore inexploit茅e : les antibiotiques ciblant l鈥橝RN bact茅rien. La sous-utilisation de cette strat茅gie est principalement due 脿 l鈥檃bsence de logiciels capables d鈥檃cc茅l茅rer leur d茅couverte. Pour r茅soudre ce probl猫me, des chercheurs de l鈥橴niversit茅 海角社区 collaborent avec la soci茅t茅 montr茅alaise Molecular Forecaster Inc. au d茅veloppement d鈥檜n logiciel permettant un criblage virtuel rapide de nouveaux antibiotiques ciblant l鈥橝RN.
2. Caract茅risation des anticorps gr芒ce 脿 la science ouverte
CP : Peter S. McPherson, professeur distingu茅聽聽James 海角社区 , D茅partements de neurologie et de neurochirurgie et d鈥檃natomie et de biologie cellulaire.
Partenaire : YCharOS Inc.
R茅sum茅 : Les anticorps sont des composantes essentielles de notre syst猫me immunitaire en raison de leur capacit茅 unique 脿 reconna卯tre toute prot茅ine, humaine ou virale, avec une grande sp茅cificit茅. Les scientifiques utilisent cette capacit茅 pour g茅n茅rer des anticorps pour la recherche, car ces derniers peuvent reconna卯tre des prot茅ines sp茅cifiques se trouvant dans des m茅langes complexes de prot茅ines tels qu鈥檕n en trouve dans les cellules humaines. Ce projet vise 脿 mettre au point une entit茅 tierce de caract茅risation des anticorps disponibles pour la recherche, qui utilise des proc茅dures standardis茅es afin d鈥櫭﹙aluer et de comparer la performance de ces anticorps, dans le but d鈥檃m茅liorer la reproductibilit茅 des donn茅es scientifiques.
3. Vers une m茅tabolomique unicellulaire : d茅couvrir l鈥檋茅t茅rog茅n茅it茅 m茅tabolique et l鈥檃rchitecture des cancers solides
CP : Peter Siegel, professeur titulaire, D茅partement de m茅decine, membre du Centre de recherche sur le cancer Rosalind et Morris Goodman, membre associ茅, D茅partements de biochimie, d鈥檃natomie et de biologie cellulaire et d鈥檕ncologie
(Collaboratrice principale : Julie Saint-Pierre, D茅partement de biochimie, microbiologie et immunologie, Institut de la biologie des syst猫mes d鈥橭ttawa, Facult茅 de m茅decine, Universit茅 d鈥橭ttawa)
Partenaire : Agilent Technologies Inc.
R茅sum茅 : La m茅tabolomique s鈥檌nt茅resse 脿 l鈥櫭﹖ude et 脿 la mesure du m茅tabolisme cellulaire gr芒ce 脿 des technologies g茅n茅rant une grande quantit茅 d鈥檌nformation, comme la spectrom茅trie de masse. Bien qu鈥檕n ait adapt茅 des protocoles de mesure de l鈥檈xpression g茅nique ou de concentrations de prot茅ines 脿 l鈥檃nalyse d鈥檜ne cellule unique, la mesure des m茅tabolites n鈥檈st actuellement possible qu鈥櫭� partir de grandes populations cellulaires ou de tissus. Pourtant, pour bien comprendre les ph茅notypes complexes 脿 l鈥櫭ヽhelle de la cellule, de nouvelles m茅thodes de m茅tabolomique unicellulaire sont n茅cessaires. L鈥檕bjectif principal de ce projet est de d茅velopper une m茅thode de mesure des m茅tabolites cibl茅s dans une cellule canc茅reuse unique.
4. Utilisation du s茅quen莽age du g茅nome entier pour 茅tablir un pont entre l鈥檈xposition humaine 脿 des agents pathog猫nes d鈥檕rigine alimentaire r茅sistants aux antimicrobiens et le fardeau r茅sultant des maladies et les co没ts de sant茅 鈥� le mod猫le du poulet
CP : Paul J. Thomassin, professeur titulaire, Programme d鈥櫭ヽonomie agricole, Facult茅 des sciences de l'agriculture et de l'environnement
(Collaborateurs principaux : Richard J. Reid-Smith, D.M.V., DVSc, v茅t茅rinaire, 茅pid茅miologiste, Agence de la sant茅 publique du Canada; Jane Parmley, D.M.V., Ph. D., v茅t茅rinaire, 茅pid茅miologiste, professeure agr茅g茅e, D茅partement de m茅decine des populations, Universit茅 de Guelph; Eduardo Taboada, Ph. D., Unit茅 de recherche en 茅pid茅miologie g茅nomique, Laboratoire national de microbiologie).
Partenaire : Agence de la sant茅 publique du Canada
R茅sum茅 : La r茅sistance aux antimicrobiens constitue un probl猫me majeur 脿 toutes les 茅tapes de la cha卯ne d鈥檃pprovisionnement alimentaire et entra卯ne des r茅percussions sanitaires et 茅conomiques importantes 脿 l鈥櫭ヽhelle nationale et internationale. En 2018, les infections bact茅riennes r茅sistantes ont 茅t茅 responsables de plus de 14 000 d茅c猫s et ont entra卯n茅 des co没ts de soins de sant茅 totalisant 1,4 milliard de dollars au Canada (CAC, 2019). L鈥橝gence de la sant茅 publique du Canada et ses partenaires ont mis au point un mod猫le d鈥櫭﹙aluation int茅gr茅e (iAM.AMR) qui mod茅lise l鈥檈xposition humaine potentielle aux bact茅ries r茅sistantes provenant de la cha卯ne d鈥檃pprovisionnement alimentaire. Ce projet permettra d鈥檌nt茅grer des donn茅es de s茅quen莽age du g茅nome entier dans le mod猫le iAM.AMR afin d鈥檃m茅liorer l鈥檈stimation de l鈥檈xposition humaine aux bact茅ries r茅sistantes aux antimicrobiens et des co没ts associ茅s 脿 la charge de morbidit茅 d茅coulant de la consommation de poulet.
5. Assemblage d鈥檜n jeu de donn茅es massif pour entra卯ner un pr茅dicteur de petites mol茅cules ciblant l鈥橝RN
CP : , professeur agr茅g茅, 脡cole d鈥檌nformatique
Partenaire : Takeda Pharmaceutical
R茅sum茅 : Les acides ribonucl茅iques (ARN) constituent une vaste classe de cibles pharmaceutiques qui demeure largement sous-exploit茅e. M锚me si nous estimons que jusqu鈥櫭� 70 % de notre g茅nome code l鈥橝RN, seule une infime fraction des mol茅cules pharmaceutiques connues ciblent ces mol茅cules. Cependant, l鈥檈xploitation de cette ressource est une t芒che ardue, qui exc猫de de loin la capacit茅 des outils de simulation informatique traditionnellement utilis茅s pour identifier de nouveaux m茅dicaments candidats. Dans ce projet, nous utiliserons un logiciel d鈥檃rrimage mol茅culaire et des protocoles exp茅rimentaux massifs pour cr茅er un jeu de donn茅es exhaustif qui servira 脿 entra卯ner notre pr茅dicteur de liaison de petites mol茅cules 脿 l鈥橝RN. Le logiciel r茅sultant sera valid茅 et exploit茅 avec notre partenaire Takeda Pharmaceutical.
G茅nome Qu茅bec
G茅nome Qu茅bec a pour mission de catalyser le d茅veloppement et l鈥檈xcellence de la recherche en g茅nomique, son int茅gration et sa d茅mocratisation. Pilier de la bio茅conomie du Qu茅bec, l鈥檕rganisme contribue 茅galement au d茅veloppement social et durable, ainsi qu鈥檃u rayonnement du Qu茅bec. Les fonds investis par G茅nome Qu茅bec proviennent du minist猫re de l鈥櫭塩onomie et de l鈥橧nnovation du Qu茅bec (MEI), du gouvernement du Canada par l鈥檈ntremise de G茅nome Canada et de partenaires priv茅s. Pour en savoir davantage, consultez .
L'Universit茅 海角社区聽
Fond茅e en 1821 脿 Montr茅al, au Qu茅bec, l鈥橴niversit茅 海角社区 figure au premier rang des universit茅s canadiennes offrant des programmes de m茅decine et de doctorat. Ann茅e apr猫s ann茅e, elle se classe parmi les meilleures universit茅s au Canada et dans le monde. 脡tablissement d鈥檈nseignement sup茅rieur renomm茅 partout dans le monde, l鈥橴niversit茅 海角社区 exerce ses activit茅s de recherche dans deux campus, 11 facult茅s et 13 茅coles professionnelles; elle compte 300 programmes d鈥櫭﹖udes et au-del脿 de 40 000 茅tudiants, dont plus de 10 200 aux cycles sup茅rieurs. Elle accueille des 茅tudiants originaires de plus de 150 pays, ses 12 800 茅tudiants internationaux repr茅sentant 31 % de sa population 茅tudiante. Au-del脿 de la moiti茅 des 茅tudiants de l鈥橴niversit茅 海角社区 ont une langue maternelle autre que l鈥檃nglais, et environ 19 % sont francophones.
